RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547085.1

HECTD4-203, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 5

Gene HECTD4, Length 1,868 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-203ENST00000547085 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.47■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 IPPQ9Y573 584 aa21.47■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 GCATO75600 419 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 TPSB2P20231 275 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 LMO2P25791 158 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 HOXC8P31273 242 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.036e-8■■■■■ 38.3
HECTD4-203ENST00000547085 BNIP1Q12981 228 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 TPSAB1Q15661 275 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 IGDCC3Q8IVU1 814 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 BANPQ8N9N5 519 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 CCDC63Q8NA47 563 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.46■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.45■■□□□ 1.03
HECTD4-203ENST00000547085 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 INHBAP08476 426 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ALADP13716 330 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 LCP1P13796 627 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MATKP42679 507 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 DNAJC3Q13217 504 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 FAM47EQ6ZV65 393 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 VPS52Q8N1B4 723 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 APBB2Q92870 758 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 KLK14Q9P0G3 267 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 CPA4Q9UI42 421 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 HACD1B0YJ81 288 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 HCRTO43612 131 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 DAB1O75553 588 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 FAM155BO75949 473 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MYL3P08590 195 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 LILRA4P59901 499 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 PTK7Q13308 1070 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 RNF39Q9H2S5 420 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.45■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MT-ND3P03897 115 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 DUSP16Q9BY84 665 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 VPS11Q9H270 941 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 USH1CQ9Y6N9 552 aa21.44■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ARL4AP40617 200 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MAGEA3P43357 314 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 NCALDP61601 193 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 FITM2Q8N6M3 262 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 RMDN2Q96LZ7 410 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ETNK1Q9HBU6 452 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 USP3Q9Y6I4 520 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 57.4
HECTD4-203ENST00000547085 MGRN1O60291 552 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 APRTP07741 180 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 PRKCHP24723 683 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 GBE1Q04446 702 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 SLC18A2Q05940 514 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 PIGZQ86VD9 579 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 HACE1Q8IYU2 909 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ZNF398Q8TD17 642 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 APOPT1Q96IL0 206 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 ECT2Q9H8V3 914 aa21.43■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 NPR3P17342 541 aa21.42■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MGAT5Q09328 741 aa21.42■■□□□ 1.02
HECTD4-203ENST00000547085 MTM1Q13496 603 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms