RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	EFNA5	P52803	228 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EMC1	Q8N766	993 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CDT1	Q9H211	546 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACKR2	O00590	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	B4GALT5	O43286	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	APOE	P02649	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NFIC	P08651	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	VAV1	P15498	845 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KRT15	P19012	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARFIP2	P53365	341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TBCC	Q15814	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CEP120	Q8N960	986 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FBXO21	O94952	628 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PROC	P04070	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GLDC	P23378	1020 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PSMA2	P25787	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ALDH3A1	P30838	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCNN1A	P37088	669 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CLCN2	P51788	898 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KLC1	Q07866	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CDC16	Q13042	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FZD9	O00144	591 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CAPN9	O14815	690 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PEX1	O43933	1283 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CAPN15	O75808	1086 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C22orf31	O95567	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LYN	P07948	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RBP3	P10745	1247 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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