RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 CD93Q9NPY3 652 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 ZFHX4Q86UP3 3567 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP3CAQ08209 521 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 CHPFQ8IZ52 775 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 P2RY11Q96G91 374 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 CYLDQ9NQC7 956 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 PILRBQ9UKJ0 227 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP8B1Q9UNU6 501 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-205ENST00000527952 WASH3PC4AMC7 463 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 IKBKBO14920 756 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CEACAM1P13688 526 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 LMAN2Q12907 356 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF394Q53GI3 561 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNV2Q8TDN2 545 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 NAGPAQ9UK23 515 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 STARD13Q9Y3M8 1113 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 AP5Z1O43299 807 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CACNG3O60359 315 aa25.31■■□□□ 1.64
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PTPRJ-205ENST00000527952 NDUFV2P19404 249 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CMA1P23946 247 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 NR2F2P24468 414 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 INCA1Q0VD86 236 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SCD5Q86SK9 330 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2I1PQ8NGU4 316 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CACNA1EQ15878 2313 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 HMBSP08397 361 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CISD3P0C7P0 127 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 DGKGP49619 791 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF33AQ06730 810 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SDE2Q6IQ49 451 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC23A3Q6PIS1 610 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 MARK1Q9P0L2 795 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 WASF3Q9UPY6 502 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 HPSEQ9Y251 543 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 NDUFA8P51970 172 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 KIF11P52732 1056 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SPATA32Q96LK8 384 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CD248Q9HCU0 757 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CHD6Q8TD26 2715 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CILPO75339 1184 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 STC2O76061 302 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT13P13646 458 aa25.28■■□□□ 1.64
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PTPRJ-205ENST00000527952 Q6ZNB5 142 aa25.28■■□□□ 1.64
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PTPRJ-205ENST00000527952 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SCNM1Q9BWG6 230 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 USP25Q9UHP3 1055 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC6A14Q9UN76 642 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 KLKB1P03952 638 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 SEMA4DQ92854 862 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 HSPA12BQ96MM6 686 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 GABRG3Q99928 467 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 DUSP16Q9BY84 665 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDH15Q96QU1 1955 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 RHOBTB3O94955 611 aa25.26■■□□□ 1.63
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