RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	EDNRB	P24530	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KRT9	P35527	623 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	UBA7	P41226	1012 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HSPA7	P48741	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	VAV2	P52735	878 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ARL4C	P56559	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HSD11B2	P80365	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	GRM1	Q13255	1194 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CT83	Q5H943	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CLTCL1	P53675	1640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ARHGEF10	O15013	1369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ACKR2	O00590	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FFAR2	O15552	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PJA2	O43164	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FRS3	O43559	492 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	KRT10	P13645	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	FOLR3	P41439	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TUB	P50607	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	CLRN1	P58418	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	DCAF7	P61962	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SEPT2	Q15019	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	APIP	Q96GX9	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PCM1-223	ENST00000524356	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	FAM170A	A1A519	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356		F8W8V4	182 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	IRAK2	O43187	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	NRP2	O60462	931 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM127	O75204	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MTA2	O94776	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	GPR15	P49685	360 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	FLT3LG	P49771	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	RAB1A	P62820	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CCNG2	Q16589	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	MEA1	Q16626	185 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
PCM1-223	ENST00000524356	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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