RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GLI1P08151 1106 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SCNN1AP37088 669 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF38Q9H0F5 515 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PATJQ8NI35 1801 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CCP110O43303 1012 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PALMO75781 387 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TCF4P15884 667 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SULT1E1P49888 294 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 EFEMP1Q12805 493 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 NME3Q13232 169 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TEAD2Q15562 447 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR153Q6NV75 609 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MIB1Q86YT6 1006 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DOCK6Q96HP0 2047 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MTA2O94776 668 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SDC4P31431 198 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR149Q86SP6 731 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TAC4Q86UU9 113 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF139Q8WU17 664 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 S1PR5Q9H228 398 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 M0QYT0 321 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 COCHO43405 550 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 NOS2P35228 1153 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 EPHA5P54756 1037 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TCEAL1Q15170 157 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 HECTD3Q5T447 861 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC16Q8NEE8 873 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 RALAP11233 206 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TNNT1P13805 278 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CEBPBP17676 345 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DAAM2Q86T65 1068 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 NPY6RQ99463 290 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 FTCDO95954 541 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 HMBSP08397 361 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CNPY3Q9BT09 278 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC46A2Q9BY10 475 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 NACA2Q9H009 215 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM7Q9H2U9 754 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 DDIT4Q9NX09 232 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PROSCO94903 275 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 COMTP21964 271 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 CDC25CP30307 473 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PSEN1P49768 467 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 COL19A1Q14993 1142 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR158Q5T848 1215 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 GCNAQ96QF7 691 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PIGVQ9NUD9 493 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ALG6Q9Y672 507 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNA5P22460 613 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 HDAC4P56524 1084 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 ARCQ7LC44 396 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 NT5C3BQ969T7 300 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-208ENST00000524325 GKN1Q9NS71 199 aa23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms