RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAD2	Q05329	585 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDSR	Q06136	332 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CETN1	Q12798	172 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DMC1	Q14565	340 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPAL2	Q16609	132 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCML4	Q8N228	414 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMA1	P25391	3075 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNG3	O60359	315 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAM23	O75077	832 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNR2	P34972	360 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRIA2	P42262	883 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS7	P49802	495 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO10	Q9UK96	956 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.32	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QYV0	167 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SGK1	O00141	431 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFRA2	O00451	464 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIK3R2	O00459	728 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOD	P05090	189 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMBS	P08397	361 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CISD3	P0C7P0	127 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCP1	P13796	627 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TYR	P14679	529 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PON1	P27169	355 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPD2	P43304	727 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFRSF4	P43489	277 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC8A3	P57103	927 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	COG7	P83436	770 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	STIL	Q15468	1287 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANO4	Q32M45	955 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TERB1	Q8NA31	727 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDEM1	Q92611	657 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACD	Q96AP0	544 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC12A8	A0AV02	714 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRRT4	C9JH25	899 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	AXIN1	O15169	862 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	APBB3	O95704	486 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FYN	P06241	537 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIE1	P35590	1138 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRY1	Q16526	586 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.3	□□□□□ -0.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	GBP6	Q6ZN66	633 aa		13.3	□□□□□ -0.28

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