RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509593.1

ABCE1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily E member 1, human

TSL 5

Gene ABCE1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCE1-208	ENST00000509593	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	RAB32	Q13637	225 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PCID2	Q5JVF3	399 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ICE2	Q659A1	982 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	RNF44	Q7L0R7	432 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	NEK8	Q86SG6	692 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TBC1D5	Q92609	795 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	SPSB4	Q96A44	273 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	EVI5L	Q96CN4	794 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	DKK4	Q9UBT3	224 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	MADD	Q8WXG6	1647 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	AQP12B	A6NM10	295 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PRRT4	C9JH25	899 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PROB1	E7EW31	1015 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PPP6C	O00743	305 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TLR5	O60602	858 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TCEA3	O75764	348 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	FES	P07332	822 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CSF1R	P07333	972 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	MYL4	P12829	197 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ENG	P17813	658 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	KLRC1	P26715	233 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	IL1R2	P27930	398 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ADORA2A	P29274	412 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	VIPR2	P41587	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	HAL	P42357	657 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PDE1A	P54750	535 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TUBA4A	P68366	448 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	MYO1E	Q12965	1108 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	IQCB1	Q15051	598 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	LY6K	Q17RY6	165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF566	Q969W8	418 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ZBTB9	Q96C00	473 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	IQCD	Q96DY2	449 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CLCA1	A8K7I4	914 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	MYO1C	O00159	1063 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	AREL1	O15033	823 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNQ3	O43525	872 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	VNN1	O95497	513 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	KCNA3	P22001	575 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CERS1	P27544	350 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PTGER1	P34995	402 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CHKA	P35790	457 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	DGKE	P52429	567 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	WNT3	P56703	355 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	CYP4F2	P78329	520 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ELF2	Q15723	593 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ABCE1-208	ENST00000509593	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		3.75	□□□□□ -1.81

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