RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLAAQ9Y263 795 aa5.9□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKRD62A6NC57 917 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 LACTBL1A8MY62 500 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EBAG9O00559 213 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 PMM2O15305 246 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EOMESO95936 686 aa5.89□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CLTBP09497 229 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 P4HA1P13674 534 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 NR1D1P20393 614 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 FUT4P22083 530 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECHS1P30084 290 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 HSD17B3P37058 310 aa5.89□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CCT5P48643 541 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MFAP3P55082 362 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 HADHBP55084 474 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CORO7P57737 925 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 DLG4P78352 724 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MGAT3Q09327 533 aa5.89□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 LPIN1Q14693 890 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRIM60Q495X7 471 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CBWD6Q4V339 395 aa5.89□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 CBWD5Q5RIA9 395 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGBL2Q5U5Z8 902 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EEF1DP3Q658K8 133 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 C11orf63Q6NUN7 778 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM228AQ86W67 206 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAAF5Q86Y56 855 aa5.89□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 BRSK2Q8IWQ3 736 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHOT2Q8IXI1 618 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EFCAB13Q8IY85 973 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM199Q8N511 208 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF169Q8NCN4 708 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 BEST2Q8NFU1 509 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC35G2Q8TBE7 412 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.89□□□□□ -1.47
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM40Q8WWA1 233 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 APBB2Q92870 758 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGEF26Q96DR7 871 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CGRRF1Q99675 332 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAM2Q99965 735 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 AP1M1Q9BXS5 423 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR88Q9GZN0 384 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 HAPLN2Q9GZV7 340 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB17Q9H0T7 212 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CARD9Q9H257 536 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAB20Q9NX57 234 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 DERAQ9Y315 318 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 SIP14410 1827 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CITO14578 2027 aa5.89□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A0U1RQF3 1178 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTI1O43156 1089 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 DAPK3O43293 454 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF623O75123 536 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTN2O75298 545 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 KRT14P02533 472 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 FGGP02679 453 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EDN1P05305 212 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 THP07101 528 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADRB2P07550 413 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYZAPP0CAP1 466 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 CXCL8P10145 99 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL6A1P12109 1028 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAG1P15918 1043 aa5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABCB4P21439 1286 aa5.88□□□□□ -1.47
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