RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	HESX1	Q9UBX0	185 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	AXIN1	O15169	862 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP26A1	O43174	497 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SETSIP	P0DME0	302 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RARG	P13631	454 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CHKA	P35790	457 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DMWD	Q09019	674 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	E2F5	Q15329	346 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CSRP2	Q16527	193 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GBP6	Q6ZN66	633 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP68	Q76N32	757 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGZ	Q86VD9	579 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF3	Q86WH2	238 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	LMO3	Q8TAP4	145 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	OSER1	Q9NX31	292 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DEC1	Q9P2X7	70 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NAGPA	Q9UK23	515 aa		18.15	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PQH9	124 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PGF	P49763	221 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF165	P49910	485 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CRY1	Q16526	586 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MEA1	Q16626	185 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA3B	Q502W6	1294 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	EOGT	Q5NDL2	527 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZNB5	142 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SCD5	Q86SK9	330 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID3A	Q99856	593 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NMUR1	Q9HB89	426 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNG3	O60359	315 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH1A2	O94788	518 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX18	O95935	607 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBED1	O96006	694 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CNGA2	Q16280	664 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PKDCC	Q504Y2	493 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NDST4	Q9H3R1	872 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCL	Q9NW38	375 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO10	Q9UK96	956 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		18.13	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	EML5	Q05BV3	1969 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424		O00370	1275 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TULP3	O75386	442 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF445	P59923	1031 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	LRMP	Q12912	555 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC30A	Q86WT1	665 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM25	Q86YD3	366 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	HSFY1	Q96LI6	401 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		18.12	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP250	Q9BV73	2442 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	NPC1	O15118	1278 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	STC2	O76061	302 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	EPN2	O95208	641 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC6A11	P48066	632 aa		18.11	■□□□□ 0.49
HDAC10-216	ENST00000489424	TKTL1	P51854	596 aa		18.11	■□□□□ 0.49

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