RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MT-CO3	P00414	261 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	AR	P10275	920 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	GABRB3	P28472	473 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	COPA	P53621	1224 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	GPS1	Q13098	491 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	AWAT1	Q58HT5	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	DPP9	Q86TI2	863 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	TNIP3	Q96KP6	325 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MYD88	Q99836	296 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CERS4	Q9HA82	394 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	COQ9	O75208	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	FGF18	O76093	207 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM225B	P0DP42	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PBX1	P40424	430 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ARHGAP25	P42331	645 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CNGA4	Q8IV77	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	GDF15	Q99988	308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6	8e-10	■□□□□ 9.7
RBM6-215	ENST00000466247	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	COL15A1	P39059	1388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247		A8MVJ9	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	TP73	O15350	636 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	KCNQ3	O43525	872 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	WDR47	O94967	919 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ABCB4	P21439	1286 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MST1	P26927	711 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MTAP	Q13126	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ETFDH	Q16134	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM65	Q6PI78	240 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	P3H2	Q8IVL5	708 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF566	Q969W8	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	C18orf8	Q96DM3	657 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SNX27	Q96L92	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	USP29	Q9HBJ7	922 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CEP83	Q9Y592	693 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	NACAD	O15069	1562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PODXL	O00592	558 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	DSCR3	O14972	297 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PLIN1	O60240	522 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	BCAR3	O75815	825 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	RNF8	O76064	485 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	ADRA1D	P25100	572 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MMP13	P45452	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	HSPA7	P48741	367 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	CLCA4	Q14CN2	919 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	MPEG1	Q2M385	716 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RBM6-215	ENST00000466247	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.04	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms