RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNA1E	Q15878	2313 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ADAMTS20	P59510	1910 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	AP1G2	O75843	785 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CLSTN1	O94985	981 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM200B	P0CF97	657 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ARSA	P15289	507 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXC13	P31276	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	MAPK8	P45983	427 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	GPR15	P49685	360 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF132	P52740	706 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	MTF1	Q14872	753 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	STIL	Q15468	1287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ANO7	Q6IWH7	933 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	C12orf29	Q8N999	325 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TTC16	Q8NEE8	873 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SMO	Q99835	787 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	DUSP16	Q9BY84	665 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	KRT82	Q9NSB4	513 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ACACA	Q13085	2346 aa		10.61	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	HHLA1	C9JL84	531 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF4	O00268	1085 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CLDN5	O00501	218 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	NFATC1	O95644	943 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CKM	P06732	381 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	VDR	P11473	427 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC130	P13994	396 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CD58	P19256	250 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	YWHAQ	P27348	245 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	GJA4	P35212	333 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	HOXD12	P35452	270 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	PSEN1	P49768	467 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC5A3	P53794	718 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	USP46	P62068	366 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	IRX4	P78413	519 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC7A9	P82251	487 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	STX1A	Q16623	288 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SGO2	Q562F6	1265 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	GBP6	Q6ZN66	633 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SYT12	Q8IV01	421 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP76	Q8TAP6	659 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CHFR	Q96EP1	664 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	KCNK16	Q96T55	309 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ARID3A	Q99856	593 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	MED10	Q9BTT4	135 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ECT2	Q9H8V3	914 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	INVS	Q9Y283	1065 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.6	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	PATE3	B3GLJ2	98 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	OPHN1	O60890	802 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	CFI	P05156	583 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SETSIP	P0DME0	302 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	BCAT1	P54687	386 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC8A3	P57103	927 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	TAF10	Q12962	218 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	USP4	Q13107	963 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
TTLL3-223	ENST00000466245	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.59	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms