RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MESD	Q14696	234 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC14	Q49A88	953 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	GAREM2	Q75VX8	874 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602		Q7L0L9	218 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	STRADA	Q7RTN6	431 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	DAAM2	Q86T65	1068 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM58	Q8NG06	486 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NT5C3B	Q969T7	300 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERPINB11	Q96P15	392 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPY6R	Q99463	290 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	OSER1	Q9NX31	292 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLEC1B	Q9P126	229 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A1W2PRU2	124 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP27X	A6NNY8	438 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602		M0QYT0	321 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TADA3	O75528	432 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	PALM	O75781	387 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	ENDOD1	O94919	500 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MOCS3	O95396	460 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	HDC	P19113	662 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	FSHR	P23945	695 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCK1	P35558	622 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTHFR	P42898	656 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	PGF	P49763	221 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATP11A	P98196	1134 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	OGDH	Q02218	1023 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTA1	Q13330	715 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NNT	Q13423	1086 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRNP1	Q6NT89	227 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	BTBD6	Q96KE9	485 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	GUCD1	Q96NT3	240 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM7	Q9C029	511 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	S1PR5	Q9H228	398 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TASP1	Q9H6P5	420 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDIT4	Q9NX09	232 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	ALG6	Q9Y672	507 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	COCH	O43405	550 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPOP	O43791	374 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBX10	O75333	385 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGLV3-25	P01717	112 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TUBB4A	P04350	444 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC2A3	P11169	496 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	LTBR	P36941	435 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCR2	P41597	374 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NTHL1	P78549	312 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	COG7	P83436	770 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CYP4F8	P98187	520 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	DEUP1	Q05D60	604 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	EFEMP1	Q12805	493 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	NME3	Q13232	169 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDO1	Q16878	200 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPR158	Q5T848	1215 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TXNDC8	Q6A555	127 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAC4	Q86UU9	113 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		9.79	□□□□□ -0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms