RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE4AQ5TA78 99 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D5Q92609 795 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 RUBCNQ92622 972 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 AP4M1O00189 453 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 NPHP1O15259 732 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SPRY2O43597 315 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3BP5O60239 455 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 EBLN1P0CF75 366 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PBX1P40424 430 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 CCT8P50990 548 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX10P56693 466 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP10-2P60368 255 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SEMA3BQ13214 749 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 GRM4Q14833 912 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 POSTNQ15063 836 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 NFRKBQ6P4R8 1299 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 TRABD2AQ86V40 505 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 P3H2Q8IVL5 708 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 GCC1Q96CN9 775 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00473A8K010 186 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 TAF5LO75529 589 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LARGE1O95461 756 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 GCP02774 474 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 C6P13671 934 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 JUPP14923 745 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 ENGP17813 658 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DRD1P21728 446 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 YY1P25490 414 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 AKT1P31749 480 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 RARRES1P49788 294 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 P3H1Q32P28 736 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCK5Q3MIX3 580 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LIN54Q6MZP7 749 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RABGGTB-205ENST00000462042 H0YIZ8 118 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXN1O15353 648 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KLRK1P26718 216 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MCM5P33992 734 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CBFBQ13951 182 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TIGD6Q17RP2 521 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF627Q7L945 461 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT27Q7Z3Y8 459 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CAGE1Q8TC20 777 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 CPT1BQ92523 772 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms