RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459154.1

RNU6-953P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 953, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-953P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-953P-201ENST00000459154 ONECUT2O95948 504 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TK1P04183 234 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TMEM225BP0DP42 221 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TGM1P22735 817 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 AKT1P31749 480 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 CCR5P51681 352 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 E2F1Q01094 437 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 DNASE1L3Q13609 305 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 BMPR2Q13873 1038 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 CSHL1Q14406 222 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 C16orf89Q6UX73 402 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 Q6YL49 198 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 Q6ZWC4 215 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 USP51Q70EK9 711 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 LRRTM4Q86VH4 590 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 SYNE4Q8N205 404 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 LRRC71Q8N4P6 559 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TFAP2BQ92481 460 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 KAZALD1Q96I82 304 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 FBXL20Q96IG2 436 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TTPALQ9BTX7 342 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 VPS45Q9NRW7 570 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 CA12O43570 354 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 PEX1O43933 1283 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 SH3BP5O60239 455 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 POLBP06746 335 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 NR2F6P10588 404 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ALADP13716 330 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 CD19P15391 556 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 YY1P25490 414 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 NBPF8Q3BBV2 869 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 VRK3Q8IV63 474 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 AFG1LQ8WV93 481 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 NPIPB3Q92617 1050 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 RUBCNQ92622 972 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 COQ10AQ96MF6 247 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 MMRN2Q9H8L6 949 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 TMEM160Q9NX00 188 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 KCND3Q9UK17 655 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 RCE1Q9Y256 329 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-953P-201ENST00000459154 E7EVH7 732 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 H0YIZ8 118 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 AP4M1O00189 453 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 PRAMEF2O60811 474 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 NXPH3O95157 252 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 ESRRBO95718 433 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 CNPP09543 421 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 CREB1P16220 341 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 KRT4P19013 534 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 CD53P19397 219 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 DRD1P21728 446 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 ADRA1DP25100 572 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 CNTFP26441 200 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 DIO1P49895 249 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 MTHFSP49914 203 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-953P-201ENST00000459154 DGKQP52824 942 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.1 ms