RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 Q6ZNB5 142 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PIGZQ86VD9 579 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPATA20Q8TB22 786 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TFAP2BQ92481 460 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC35C1Q96A29 364 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ACDQ96AP0 544 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LOXL4Q96JB6 756 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BBS2Q9BXC9 721 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NAGPAQ9UK23 515 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LNP1A1A4G5 178 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C4orf47A7E2U8 309 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRT37O76014 449 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RHOBTB1O94844 696 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADRB1P08588 477 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GTF2H1P32780 548 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 P2RY2P41231 377 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLA2G4AP47712 749 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MXI1P50539 228 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TKTL1P51854 596 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PDE4CQ08493 712 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RAB41Q5JT25 222 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TMEM215Q68D42 235 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PGBD3Q8N328 593 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UBR7Q8N806 425 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TERB1Q8NA31 727 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LMO3Q8TAP4 145 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EDEM1Q92611 657 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PIGKQ92643 395 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EXOC4Q96A65 974 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VPS45Q9NRW7 570 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DEC1Q9P2X7 70 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 THADAQ6YHU6 1953 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLC12A8A0AV02 714 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 E7ENQ6 273 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BIN1O00499 593 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CACNG3O60359 315 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SDHBP21912 280 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ITPKAP23677 461 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RGS7P49802 495 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SGSHP51688 502 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 STX17P56962 302 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ENPEPQ07075 957 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CUL2Q13617 745 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GEN1Q17RS7 908 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PKDCCQ504Y2 493 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 EOGTQ5NDL2 527 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FYB2Q5VWT5 728 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RNF43Q68DV7 783 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RRAGAQ7L523 313 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DENND1CQ8IV53 801 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SMARCE1Q969G3 411 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 OTUB2Q96DC9 234 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GSDMAQ96QA5 445 aa8.03□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms