RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 CNPY3Q9BT09 278 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 POPDC2Q9HBU9 364 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GOLGA8SH3BPF8 625 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT86O43790 486 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PROSCO94903 275 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 IGLV3-27P01718 113 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 RHOP08100 348 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 MYL4P12829 197 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 FSHRP23945 695 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 WEE1P30291 646 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 NOS2P35228 1153 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TFF2Q03403 129 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC14Q49A88 953 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 POTEHQ6S545 545 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 EMC1Q8N766 993 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SUSD6Q92537 303 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SELENOOQ9BVL4 669 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 RRN3Q9NYV6 651 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 FANCGO15287 622 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 IRAK2O43187 625 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CCP110O43303 1012 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TLR5O60602 858 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 LRCH4O75427 683 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GRAP2O75791 330 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GPD1P21695 349 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PCK1P35558 622 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 HDAC4P56524 1084 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ACAP1Q15027 740 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 STRADAQ7RTN6 431 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TAC4Q86UU9 113 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB106AQ8N104 65 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 RXFP2Q8WXD0 754 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CD101Q93033 1021 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC39A13Q96H72 371 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ASB2Q96Q27 587 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM51Q9NW97 253 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.849e-7■■□□□ 14.4
SH3BP4-207ENST00000454947 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 I6L893 689 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 COCHO43405 550 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 GREM1O60565 184 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 RARGP13631 454 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP4-207ENST00000454947 TCF3P15923 654 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms