RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEB18Q96M61 343 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 WRNIP1Q96S55 665 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRA2Q96PE1 1338 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM49BA6NDI0 452 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 A8MVJ9 347 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DAPK3O43293 454 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NIPSNAP2O75323 286 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TADA2AO75478 443 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CBX6O95503 412 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PLATP00750 562 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA4P43358 317 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CYP27A1Q02318 531 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SEC23AQ15436 765 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 EXT2Q93063 718 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GIMAP5Q96F15 307 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TTPALQ9BTX7 342 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RMND5AQ9H871 391 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HEY2Q9UBP5 337 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 STAP2Q9UGK3 403 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PNMA3Q9UL41 463 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RAB23Q9ULC3 237 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHA7Q9UN72 937 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 NEDD4P46934 1319 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DENND3A2RUS2 1198 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF862O60290 1169 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 BPNT1O95861 308 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FCER2P06734 321 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PRKCAP17252 672 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJB2P25686 324 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CARD18P57730 90 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 EVA1CP58658 441 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TRAF3Q13114 568 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RNF43Q68DV7 783 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 IDI2Q9BXS1 227 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PLK2Q9NYY3 685 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRE2Q9UHX3 823 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 GLS2Q9UI32 602 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 TNNQ9UQP3 1299 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF175Q9Y473 711 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 J3QRK9 145 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC3O15379 428 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB14O43829 449 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 RARAP10276 462 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CDK4P11802 303 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CTRB1P17538 263 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 HNF1AP20823 631 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CNTFP26441 200 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 ZAP70P43403 619 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 INHBCP55103 352 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 STX4Q12846 297 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CUL2Q13617 745 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 PHKG1Q16816 387 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FAM209BQ5JX69 171 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRC-209ENST00000442510 MAMSTRQ6ZN01 415 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms