RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438705.3

SNHG15-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 15, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SNHG15, Length 509 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG15-201ENST00000438705 CETN1Q12798 172 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 PAK1Q13153 545 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 CAMK4Q16566 473 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 EOGTQ5NDL2 527 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 NELFBQ8WX92 580 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 MED10Q9BTT4 135 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.65□□□□□ -0.54
SNHG15-201ENST00000438705 AP5Z1O43299 807 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 GNA14O95837 355 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 RDXP35241 583 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PDE6CP51160 858 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SCAPQ12770 1279 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 MORC3Q14149 939 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 FAM171BQ6P995 826 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PROSER1Q86XN7 944 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TTC39CQ8N584 583 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PCED1BQ96HM7 432 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 NUP62CLQ9H1M0 184 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.64□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TBC1D3BA6NDS4 549 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 F8VP50 259 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SH3BP5O60239 455 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ADH1CP00326 375 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SERPINF2P08697 491 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CD59P13987 128 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 GABRG2P18507 467 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 GRIA2P42262 883 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CDH8P55286 799 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SLC7A9P82251 487 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ZNF33AQ06730 810 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PPP3CAQ08209 521 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 FOXR2Q6PJQ5 311 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PDZD3Q86UT5 571 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 UNC93AQ86WB7 457 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SMARCD1Q96GM5 515 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SPATA17Q96L03 361 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CLSTN2Q9H4D0 955 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CAPN10Q9HC96 672 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CD93Q9NPY3 652 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 57.3
SNHG15-201ENST00000438705 RAB20Q9NX57 234 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 DACH1Q9UI36 760 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 GPSM3Q9Y4H4 160 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SHROOM3Q8TF72 1996 aa11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TMEM131Q92545 1883 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 H0Y626 953 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ARHGAP33O14559 1287 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TRIM24O15164 1050 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TRIM16O95361 564 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 IRF1P10914 325 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 HOXB2P14652 356 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CD58P19256 250 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TNFRSF4P43489 277 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ASPAP45381 313 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 NDST1P52848 882 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 CACNA2D1P54289 1103 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TAF10Q12962 218 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 ANO4Q32M45 955 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 C10orf76Q5T2E6 689 aa11.62□□□□□ -0.55
SNHG15-201ENST00000438705 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms