RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-215	ENST00000438141	MAGEA4	P43358	317 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CDK7	P50613	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CDR1	P51861	262 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	RABGGTB	P53611	331 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	GNGT1	P63211	74 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141		E7ENQ6	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	RASGRF2	O14827	1237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23	2e-6	■■□□□ 13.3
TTLL3-215	ENST00000438141	AGT	P01019	485 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TYMP	P19971	482 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	NRL	P54845	237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	BCAR1	P56945	870 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	GPNMB	Q14956	572 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ALOX15B	O15296	676 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	DDHD2	O94830	711 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TMEM63A	O94886	807 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SCML4	Q8N228	414 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23	2e-7	■□□□□ 9.8
TTLL3-215	ENST00000438141	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TLDC2	A0PJX2	215 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141		E7ESA3	106 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SMAP	O00193	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SELP	P16109	830 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	GUCY1A3	Q02108	690 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	GAD2	Q05329	585 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CBLB	Q13191	982 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	LONRF1	Q17RB8	773 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-215	ENST00000438141	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms