RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NELL1	Q92832	810 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GAN	Q9H2C0	597 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	BECN2	A8MW95	431 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	LTF	P02788	710 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	UCHL3	P15374	230 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NCAPH	Q15003	741 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PON2	Q15165	354 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IER5L	Q5T953	404 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PNKP	Q96T60	521 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	OSER1	Q9NX31	292 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		11.52	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	APOD	P05090	189 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CNR2	P34972	360 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	KRT9	P35527	623 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GREM1	O60565	184 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	STC2	O76061	302 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	LCP1	P13796	627 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TNK2	Q07912	1038 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SERPINB11	Q96P15	392 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NCOR1	O75376	2440 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160		F8VZ95	297 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NPC1	O15118	1278 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SP9	P0CG40	484 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	USP8	P40818	1118 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	STAT1	P42224	750 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GRIA2	P42262	883 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZXDB	P98169	803 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	VPS16	Q9H269	839 aa		11.51	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IRAK2	O43187	625 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CYBB	P04839	570 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GALK1	P51570	392 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	JAM2	P57087	298 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PDCL	Q13371	301 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A1W2PQC6	194 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	IGLV3-27	P01718	113 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CLCN1	P35523	988 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SOX5	P35711	763 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CXCL12	P48061	93 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF165	P49910	485 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		11.5	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC12A8	A0AV02	714 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	CACNG3	O60359	315 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC2A3	P11169	496 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	TDGF1	P13385	188 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	GBP1	P32455	592 aa		11.49	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	OPRD1	P41143	372 aa		11.49	□□□□□ -0.57

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