RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 DMWDQ09019 674 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PASD1Q8IV76 773 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SCUBE3Q8IX30 993 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SCML4Q8N228 414 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CD101Q93033 1021 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 HSFY1Q96LI6 401 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MIS12Q9H081 205 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.26□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SLC12A8A0AV02 714 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FAM170AA1A519 330 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 K7EQS6 105 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 K7ESF4 209 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LAMTOR5O43504 91 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 RNF40O75150 1001 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ADH5P11766 374 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 UCHL3P15374 230 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PDCLQ13371 301 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC32Q14392 662 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FMNL3Q8IVF7 1028 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGAP18Q8N392 663 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NAT16Q8N8M0 369 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NELL1Q92832 810 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FAM81BQ96LP2 452 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SPHK2Q9NRA0 654 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ST7Q9NRC1 585 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.25□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SYCE3A1L190 88 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 E5RJQ4 531 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MED7O43513 233 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DRD1P21728 446 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MRE11P49959 708 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NR1H3Q13133 447 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TAF5Q15542 800 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 MEA1Q16626 185 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM110Q86TL2 294 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 IRGQQ8WZA9 623 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 OTUB2Q96DC9 234 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CPXM1Q96SM3 734 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 HCN2Q9UL51 889 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa11.24□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PIEZO1Q92508 2521 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LGALS16A8MUM7 142 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PROB1E7EW31 1015 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 F8VZ95 297 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TEX33O43247 280 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 TULP3O75386 442 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 ADH1CP00326 375 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 LTFP02788 710 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CYP11B1P15538 503 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 CXCL12P48061 93 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 SEC13P55735 322 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 JAM2P57087 298 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 COG7P83436 770 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 AMPD2Q01433 879 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 GAD2Q05329 585 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-210ENST00000428861 PTK2Q05397 1052 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms