RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMC2Q8NEN0 867 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF157Q96PX1 679 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CNPY3Q9BT09 278 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD8Q9H461 694 aa19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR25O00155 361 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT1A9O60656 530 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG6O75602 509 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 GCKP35557 465 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL4Q14679 1199 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR60Q8WVS4 1066 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFATQ9P243 1243 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PAK5Q9P286 719 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 STOML1Q9UBI4 398 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 GINS2Q9Y248 185 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QAP02745 245 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGCRP04035 888 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 IQCF3P0C7M6 154 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TGFB3P10600 412 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF792Q3KQV3 632 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM47CQ5HY64 1035 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 LMNTD2Q8IXW0 634 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TEX9Q8N6V9 391 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PLD5Q8N7P1 536 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 DTX3LQ8TDB6 740 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NMRK1Q9NWW6 199 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD4BA6NLJ0 364 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT37O76014 449 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TMPRSS15P98073 1019 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP1Q07960 439 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 RFX8Q6ZV50 586 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 POPDC2Q9HBU9 364 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB561D2O14569 222 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NVLO15381 856 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 IL18RAPO95256 599 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBED1O96006 694 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS7P49802 495 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNA1P78396 465 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 BST1Q10588 318 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL14Q16627 93 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MDH1BQ5I0G3 518 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SMYD2Q9NRG4 433 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NHS1 94 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 I3L4J1 428 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 STAG3L1P0CL83 205 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 KITP10721 976 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP3A5P20815 502 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX19P40855 299 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAR1P56945 870 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC110Q8TBZ0 833 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAC1Q9HBJ0 212 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PNPLA8Q9NP80 782 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 PLLPQ9Y342 182 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CAPN9O14815 690 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 VTNP04004 478 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 IL4RP24394 825 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MBTD1Q05BQ5 628 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT72Q14CN4 511 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 SNX30Q5VWJ9 437 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB12Q6NXP0 572 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 GAS2O43903 313 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 LINGO3P0C6S8 592 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 VDRP11473 427 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ACADSP16219 412 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 VHLP40337 213 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NDST1P52848 882 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CES4AQ5XG92 561 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 NRG4Q8WWG1 115 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ACAP3Q96P50 834 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ETNK2Q9NVF9 386 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN16Q9UKR8 245 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 APOL1O14791 398 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS2P05162 132 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 ENO1P06733 434 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 RARBP10826 455 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 INSRRP14616 1297 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CHI3L2Q15782 390 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CA9Q16790 459 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP7D3Q8IWC1 876 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC33Q8N5R6 958 aa19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms