RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 VPS33AQ96AX1 596 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 OPALINQ96PE5 141 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CUEDC2Q9H467 287 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 STARD7Q9NQZ5 370 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 BARHL2Q9NY43 387 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 KIF17Q9P2E2 1029 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PCDHA4Q9UN74 947 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TFR2Q9UP52 801 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PLIN4Q96Q06 1357 aa7□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM172BPA6NC97 362 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 A8MU76 341 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 H0YGN5 161 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC22O60826 627 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 EPHB2P29323 1055 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ARHGDIAP52565 204 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 RAC1P63000 192 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CDC20Q12834 499 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TRPC3Q13507 836 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PSME4Q14997 1843 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TCEAL1Q15170 157 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SDE2Q6IQ49 451 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 KCTD1Q719H9 257 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ENKURQ8TC29 256 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SERINC2Q96SA4 455 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 THAP9Q9H5L6 903 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 NFS1Q9Y697 457 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TLDC2A0PJX2 215 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 A6NCN8 305 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC22A1O15245 554 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ADAM11O75078 769 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 BMP10O95393 424 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TFAP2AP05549 437 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SNHG28P0DPA3 235 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 NR4A1P22736 598 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 HSD17B3P37058 310 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 AFMP43652 599 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SNAP25P60880 206 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ERVK-24P63145 666 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 FOLH1Q04609 750 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 VSIG1Q86XK7 387 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 FBXL6Q8N531 539 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TAMM41Q96BW9 452 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CNDP1Q96KN2 507 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 MNTQ99583 582 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CNTN3Q9P232 1028 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 OR5K3A6NET4 321 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 AP1G1O43747 822 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SSX5O60225 188 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 PHF2O75151 1096 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SULT1C4O75897 302 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 USP1O94782 785 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 GYPCP04921 128 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 HSMCR30P0CW71 290 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 SMIM18P0DKX4 95 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 RAC2P15153 192 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CHN2P52757 468 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 STX1BP61266 288 aa6.99□□□□□ -1.29
LRRTM4-205ENST00000409911 CYP4F2P78329 520 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms