RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 SDK1Q7Z5N4 2213 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 BICDL2A1A5D9 508 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 CD44P16070 742 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 FMO5P49326 533 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 BCAT1P54687 386 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 CETN1Q12798 172 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 EFEMP1Q12805 493 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 EMC10Q5UCC4 262 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 SCD5Q86SK9 330 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 TERB1Q8NA31 727 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 ANKRD52Q8NB46 1076 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 MDGA1Q8NFP4 955 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 BHMTQ93088 406 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 CLIC5Q9NZA1 410 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 USP3Q9Y6I4 520 aa26.77■■□□□ 1.88
FAAP20-202ENST00000378546 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SGK1O00141 431 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 HMBSP08397 361 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TYRP14679 529 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 MPLP40238 635 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TKTL1P51854 596 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 C11orf74Q86VG3 221 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PGBD3Q8N328 593 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PHTF2Q8N3S3 785 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 NT5C1BQ96P26 610 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 CREB5Q02930 508 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM92Q6UXU6 159 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 RASSF3Q86WH2 238 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 GREM1O60565 184 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 STC2O76061 302 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 COG7P83436 770 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 HMGB4Q8WW32 186 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SPACA7Q96KW9 195 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 CACNA1AO00555 2505 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 A0A0A0MRY4 1105 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM24O15164 1050 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 CACNG3O60359 315 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 GDF9O60383 454 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 STX17P56962 302 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PDE4CQ08493 712 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TTI2Q6NXR4 508 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM270Q6UE05 265 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 MARK1Q9P0L2 795 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF510Q9Y2H8 683 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.73■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SLC30A4O14863 429 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ZBED1O96006 694 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF806P0C7X5 589 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 VDRP11473 427 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 KCNA4P22459 653 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 DGKGP49619 791 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ADIGQ0VDE8 80 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PAK1Q13153 545 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 MORC3Q14149 939 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 RAB41Q5JT25 222 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF276Q8N554 614 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 UBA3Q8TBC4 463 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 DCLK3Q9C098 648 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 VPS45Q9NRW7 570 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PLK2Q9NYY3 685 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SLC12A8A0AV02 714 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 TULP2O00295 520 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 ADAM23O75077 832 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 HOXB2P14652 356 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 WASP42768 502 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 IL31Q6EBC2 164 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 SDE2Q6IQ49 451 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 Q6ZNB5 142 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 KCNV2Q8TDN2 545 aa26.71■■□□□ 1.87
FAAP20-202ENST00000378546 THADAQ6YHU6 1953 aa26.7■■□□□ 1.86
FAAP20-202ENST00000378546 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms