RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 TTLL2Q9BWV7 592 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR26Q9H7D7 661 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RGL1Q9NZL6 768 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 DKK4Q9UBT3 224 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CDC23Q9UJX2 597 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 A0A087WV62 115 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TMPRSS11DO60235 418 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TCEA3O75764 348 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SRGAP2BP0DMP2 458 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP2D6P10635 497 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 HGFP14210 728 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ENGP17813 658 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 MST1P26927 711 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 EPHB2P29323 1055 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 UQCRC1P31930 480 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP2C18P33260 490 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP4F2P78329 520 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CBFBQ13951 182 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNAB1Q14722 419 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ELF2Q15723 593 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ETFDHQ16134 617 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 P3H1Q32P28 736 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CEP78Q5JTW2 689 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 MANEALQ5VSG8 457 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC9A4Q6AI14 798 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D5Q92609 795 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NFU1Q9UMS0 254 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 A8MVJ9 347 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 EXOC5O00471 708 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CES2O00748 559 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KCNQ3O43525 872 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PLA2G6O60733 806 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 JTBO76095 146 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NDST3O95803 873 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ITGA2BP08514 1039 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM225BP0DP42 221 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ITGB6P18564 788 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 KELP23276 732 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 YY1P25490 414 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SERPINB3P29508 390 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 GSTM5P46439 218 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TIRAPP58753 221 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TRIM14Q14142 442 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CSHL1Q14406 222 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 RAB30Q15771 203 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZACNQ401N2 412 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC38Q502W7 563 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C4orf46Q504U0 113 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PCID2Q5JVF3 399 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NEK8Q86SG6 692 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF366Q8N895 744 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATA5Q8NB90 893 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 LRFN1Q9P244 771 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 AMFRQ9UKV5 643 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PRRT4C9JH25 899 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 SYT5O00445 386 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR47O94967 919 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE8BO95263 885 aa3.37□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 CSTBP04080 98 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNORD3E-201ENST00000362899 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms