RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPD1LQ8N335 351 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 BEST2Q8NFU1 509 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CASP10Q92851 521 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 APOL5Q9BWW9 433 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2CD2Q9Y426 696 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 M0QZQ0 153 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PIRO00625 290 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TGM5O43548 720 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAPPC3O43617 180 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D4O60343 1298 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRAMEF1O95521 474 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRGAP2BP0DMP2 458 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYP2J2P51589 502 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LILRA4P59901 499 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CREMQ03060 361 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSMD5Q16401 504 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LILRA6Q6PI73 481 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PALB2Q86YC2 1186 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CXorf38Q8TB03 319 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA20Q8TB22 786 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 SUSD6Q92537 303 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCTN2Q96GX1 697 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM84AQ96KN4 292 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TIGD1Q96MW7 591 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 DMAC2Q9NW81 257 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 DPP3Q9NY33 737 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTRRQ9UBK8 725 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDH22Q9UJ99 828 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCFL5Q9UL49 500 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTPRJQ12913 1337 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU1-38P-201ENST00000362817 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSC2P49815 1807 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF233A6NK53 670 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYN3O14994 580 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLUD1P00367 558 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 C1RP00736 705 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA31D3P0C874 917 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYP24A1Q07973 514 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDXDC1Q6P996 788 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 BORCS6Q96GS4 357 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD320Q9NPF0 282 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIX4Q9UIU6 781 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCN1AP35498 2009 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDXKO00764 312 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 NR3C1P04150 777 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITGB3P05106 788 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 WEE2P0C1S8 567 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1D2P34982 312 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU1-38P-201ENST00000362817 GIPRP48546 466 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms