RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 ADIGQ0VDE8 80 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF365Q70YC5 407 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MGARPQ8TDB4 240 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KCNK16Q96T55 309 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OR6C75A6NL08 312 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZBBXA8MT70 800 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 H7C4K7 107 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NDUFB5O43674 189 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GRAP2O75791 330 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TAS2R40P59535 323 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMED1Q13445 227 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TAF5Q15542 800 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RAB41Q5JT25 222 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA1Q92805 767 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IGSF21Q96ID5 467 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TTPALQ9BTX7 342 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CARD9Q9H257 536 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.32□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DPYSL4O14531 572 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EPHB4P54760 987 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C2orf54Q08AI8 447 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RTP2Q5QGT7 225 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TRNP1Q6NT89 227 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF558Q96NG5 402 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D4O60343 1298 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FBXO21O94952 628 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TCF4P15884 667 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PDGFRAP16234 1089 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LAG3P18627 525 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HALP42357 657 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NDUFV1P49821 464 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TKTL1P51854 596 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ACAP1Q15027 740 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BRD3Q15059 726 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 USP41Q3LFD5 358 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMEM240Q5SV17 173 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 AADACL2Q6P093 401 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARCQ7LC44 396 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 YME1L1Q96TA2 773 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IER2Q9BTL4 223 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MAFFQ9ULX9 164 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PYGMP11217 842 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SYN1P17600 705 aa6.31□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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