RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 F8VZ95 297 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 MAPK1P28482 360 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ADIGQ0VDE8 80 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 DIP2AQ14689 1571 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 WBP4O75554 376 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 KLRC2P26717 231 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 METTL7BQ6UX53 244 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 CNPY4Q8N129 248 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 E9PBE3 544 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL41O60662 606 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 KATNA1O75449 491 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 GSTM1P09488 218 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 RRM2P31350 389 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH9A1P49189 494 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 HERVK_113P62684 666 aa23.02■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 CNPY3Q9BT09 278 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8TH3BQL2 631 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 AKAP3O75969 853 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM150BA6NC51 233 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 IRAK1P51617 712 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC3Q9BQI4 270 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 NDEL1Q9GZM8 345 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 IGFLR1Q9H665 355 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SYT15Q9BQS2 421 aa23.02■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 ERMARDQ5T6L9 678 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 E9PCH4 1651 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1B2P21281 511 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC126Q96EE4 140 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM66O15016 1216 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CCNG1P51959 295 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CXCL9Q07325 125 aa23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 ILDR2Q71H61 639 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 C4orf19Q8IY42 314 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 AGRPO00253 132 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 NLRP9Q7RTR0 991 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 REXO1L1PQ8IX06 675 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SERAC1Q96JX3 654 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRM-201ENST00000332175 MFSD10Q14728 455 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEB18Q96M61 343 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 FGFR2P21802 821 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CEP78Q5JTW2 689 aa23■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf59Q7L2K0 433 aa23■■□□□ 1.27
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