RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 NAT8LQ8N9F0 302 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC42Q9Y546 428 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ZWINTO95229 277 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 APOC2P02655 101 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 FESP07332 822 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 P4HA1P13674 534 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 VHLP40337 213 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 GTF2A2P52657 109 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 AP3M2P53677 418 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 GHRHRQ02643 423 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 SURF1Q15526 300 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TEX9Q8N6V9 391 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 RSAD1Q9HA92 442 aa20.61■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC38Q5VT99 294 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 AFG1LQ8WV93 481 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DPP3Q9NY33 737 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 A8MXQ7 604 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 APOL1O14791 398 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TCEA3O75764 348 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 AMPD1P23109 780 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 AKAP5P24588 427 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 EML3Q32P44 896 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PMF1Q6P1K2 205 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 NUDCD3Q8IVD9 361 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 OSBPP22059 807 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 GBE1Q04446 702 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 EFHC2Q5JST6 749 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 C10orf82Q8WW14 230 aa20.6■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TYROBPO43914 113 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PTPN4P29074 926 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 NME3Q13232 169 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TFDP2Q14188 446 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 MPP5Q8N3R9 675 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 KLC2Q9H0B6 622 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 EVPLQ92817 2033 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 MAP3K7O43318 606 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DESP17661 470 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC142Q17RM4 750 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 NT5C1AQ9BXI3 368 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 USP12O75317 370 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 KRT37O76014 449 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PIGRP01833 764 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PDE1BQ01064 536 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 AP1B1Q10567 949 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 RSPH3Q86UC2 560 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 SNTG2Q9NY99 539 aa20.59■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 B2RBV5 119 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC130P13994 396 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 PGM1P36871 562 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.58■□□□□ 0.89
SPNS2-201ENST00000329078 MEI4A8MW99 385 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 PFDN1O60925 122 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 SETSIPP0DME0 302 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 ADAM32Q8TC27 787 aa20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SPNS2-201ENST00000329078 CNPY3Q9BT09 278 aa20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms