RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 RNF149Q8NC42 400 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 HIPK4Q8NE63 616 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 SIP14410 1827 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 SPAG6O75602 509 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 METTL18O95568 372 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 APBA3O96018 575 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 APOEP02649 317 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ETS2P15036 469 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 STKLD1Q8NE28 680 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RNF157Q96PX1 679 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 SIX4Q9UIU6 781 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.5■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CXCL8P10145 99 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 KCNA4P22459 653 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 AP3M2P53677 418 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 EPHB1P54762 984 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 STX3Q13277 289 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZPBP2Q6X784 338 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZNF534Q76KX8 674 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RSPH3Q86UC2 560 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PQLC3Q8N755 202 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CDHR1Q96JP9 859 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PAK5Q9P286 719 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ENDOD1O94919 500 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 GSRP00390 522 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PRKCBP05771 671 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PDGFRAP16234 1089 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CRABP2P29373 138 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 TUBB3Q13509 450 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 KRT81Q14533 505 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 C6orf163Q5TEZ5 329 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.49■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 E2F8A0AVK6 867 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 SERPINA6P08185 405 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 GSTT1P30711 240 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CRADDP78560 199 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 SFT2D3Q587I9 215 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CFAP157Q5JU67 520 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 TRIM50Q86XT4 487 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZFAND2BQ8WV99 257 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PDP2Q9P2J9 529 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MED7O43513 233 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZBED1O96006 694 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 NFICP08651 508 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 GPD2P43304 727 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 GSTA3Q16772 222 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CNPY1Q3B7I2 92 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.48■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 TNNC2P02585 160 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CYP3A5P20815 502 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RGS7P49802 495 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 RASIP1Q5U651 963 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MAVSQ7Z434 540 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZMPSTE24O75844 475 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 GPD1P21695 349 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 BACE1P56817 501 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 BCAR1P56945 870 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 CXCL9Q07325 125 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.47■■□□□ 1.19
ELL3-201ENST00000319359 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms