RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 HSMCR30P0CW71 290 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 IL5RAQ01344 420 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 VAC14Q08AM6 782 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM131BQ86XD5 332 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN10Q9HC96 672 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS13Q9NVM9 706 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINE1P05121 402 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC153Q494R4 210 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 STAG3L1P0CL83 205 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 RAG1P15918 1043 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2B6P20813 491 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-9P63128 1117 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG16L2Q8NAA4 619 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR48Q8TAF3 677 aa24.83■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G6O60733 806 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 GLP2RO95838 553 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 KLRK1P26718 216 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTL9Q8TC94 416 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC5A5Q92911 643 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 MIEF2Q96C03 454 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 NDEL1Q9GZM8 345 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ELK3P41970 407 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CPT1AP50416 773 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP1BQ7LBR1 199 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD13C9JR72 458 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 GRTP1Q5TC63 336 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD23AP54725 363 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 MYL6P60660 151 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0895Q8NCT3 520 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PDGFCQ9NRA1 345 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 DAPK2Q9UIK4 370 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 DOLKQ9UPQ8 538 aa24.82■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CYB561D2O14569 222 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CRTAMO95727 393 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 JCHAINP01591 159 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 C10orf53Q8N6V4 93 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CLPBQ9H078 707 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 DIABLOQ9NR28 239 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 TSC22D2O75157 780 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 TPBGLP0DKB5 382 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 OXCT1P55809 520 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 BHMTQ93088 406 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM20BO75063 409 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMB9P28065 219 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 GPC1P35052 558 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT20P35900 424 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 CPB2Q96IY4 423 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNA14P01570 189 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 LRCH1Q9Y2L9 728 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRB3O60242 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO21O94952 628 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.81■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF862O60290 1169 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SASH3O75995 380 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 BCL10O95999 233 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA9Q13797 1035 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PRMT9Q6P2P2 845 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3R5Q8WYR1 880 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP1Q9NVV9 213 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PRKAA1Q13131 559 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP1A4Q13733 1029 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 ARMC6Q6NXE6 501 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPHS2Q99611 448 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR27A2RRH5 827 aa24.8■■□□□ 1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms