RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 PCDH19Q8TAB3 1148 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 FAM172AQ8WUF8 416 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.05■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 PIK3R2O00459 728 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 GRAP2O75791 330 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 APRTP07741 180 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SETSIPP0DME0 302 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 GCKP35557 465 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB10Q96DT7 871 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 DPP3Q9NY33 737 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 STOML1Q9UBI4 398 aa29.04■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V1C1P21283 382 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 MAGEA3P43357 314 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 MCUR1Q96AQ8 359 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 PLAC1Q9HBJ0 212 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 FCHO1O14526 889 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 RFPL1O75677 317 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.246e-11■■■■□ 20.7
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UBP1-201ENST00000283628 SNX16P57768 344 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SLC6A3Q01959 620 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 RFWD3Q6PCD5 774 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 VPS52Q8N1B4 723 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SIRPGQ9P1W8 387 aa29.03■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WZ62 844 aa29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 COPS5Q92905 334 aa29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A5Q9BY07 1137 aa29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 RNPEPQ9H4A4 650 aa29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.242e-12■□□□□ 9.4
UBP1-201ENST00000283628 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 H0Y3Z8 333 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 TPSB2P20231 275 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 TPSAB1Q15661 275 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 PKDCCQ504Y2 493 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 SESTD1Q86VW0 696 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP24Q8N264 748 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 GSDMBQ8TAX9 411 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 E2F7Q96AV8 911 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 CPB2Q96IY4 423 aa29.01■■■□□ 2.24
UBP1-201ENST00000283628 GLTPD2A6NH11 291 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 GCATO75600 419 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 ACADSP16219 412 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 SERPINB9P50453 376 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 TTLL4Q14679 1199 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 KCTD2Q14681 263 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 FAXCQ5TGI0 409 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 UNC5AQ6ZN44 842 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 TMEM110Q86TL2 294 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 LINC01465Q8N7H1 131 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 ACAP3Q96P50 834 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 TAS2R1Q9NYW7 299 aa29.01■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 FAM159BA6NKW6 160 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 RARBP10826 455 aa29■■■□□ 2.23
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UBP1-201ENST00000283628 RGS7P49802 495 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 Q3C1V9 767 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 DSTYKQ6XUX3 929 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 RINLQ6ZS11 566 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa29■■■□□ 2.23
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UBP1-201ENST00000283628 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa29■■■□□ 2.23
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UBP1-201ENST00000283628 GJA5P36382 358 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 ABL2P42684 1182 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 IGBP1P78318 339 aa29■■■□□ 2.23
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UBP1-201ENST00000283628 BST1Q10588 318 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 PMF1Q6P1K2 205 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 LMNTD2Q8IXW0 634 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 C12orf29Q8N999 325 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 CCDC110Q8TBZ0 833 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 MMP19Q99542 508 aa29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
UBP1-201ENST00000283628 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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