RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 DCAF6Q58WW2 860 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SNX32Q86XE0 403 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PKP2Q99959 881 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RNPEPQ9H4A4 650 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TBCCD1Q9NVR7 557 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 THAP1Q9NVV9 213 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DSG3P32926 999 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CLCN2P51788 898 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CD300CQ08708 224 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BNIP3Q12983 259 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MAMLD1Q13495 774 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPP2R5DQ14738 602 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 HELQQ8TDG4 1101 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINB7O75635 380 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 COX4I1P13073 169 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 P4HA1P13674 534 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TRAF2Q12933 501 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 Q6ZNX1 250 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SV2AQ7L0J3 742 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MARK4Q96L34 752 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GID8Q9NWU2 228 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RAB26Q9ULW5 256 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 BTBD19C9JJ37 291 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 P4HBP07237 508 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 BCAP31P51572 246 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 CARTPTQ16568 116 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 KCTD6Q8NC69 237 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 A0A0B4J269 797 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1W2PPW3 197 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 TPST1O60507 370 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 GMNNO75496 209 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A6P19224 532 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A1P22309 533 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A4P22310 534 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 PSMA2P25787 234 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A3P35503 534 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 UGT1A5P35504 534 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 GNA12Q03113 381 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRE1Q14246 886 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 NEDD8Q15843 81 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 ADRM1Q16186 407 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 FSCBQ5H9T9 825 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 ACTRT2Q8TDY3 377 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 NGLY1Q96IV0 654 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 BCAP29Q9UHQ4 241 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 VPS51Q9UID3 782 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.77□□□□□ -0.53
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF536O15090 1300 aa11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms