RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
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NICN1-201ENST00000273598 ADAM32Q8TC27 787 aa15.2■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.2■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 LRFN2Q9ULH4 789 aa15.2■□□□□ 0.02
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NICN1-201ENST00000273598 RASGRF2O14827 1237 aa15.17■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 COL6A1P12109 1028 aa15.17■□□□□ 0.02
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