RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 POLD4Q9HCU8 107 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GGA2Q9UJY4 613 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TBX20Q9UMR3 447 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG6Q9Y672 507 aa7.41□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ESYT3A0FGR9 886 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF233A6NK53 670 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFAB1O14561 156 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TM4SF5O14894 197 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GIPC1O14908 333 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NCAM2O15394 837 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DAPK3O43293 454 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNK5O95279 499 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP1A2P05177 515 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM153BP0C7A2 387 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 VSIG8P0DPA2 414 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMP2P16035 220 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXC13P31276 330 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC1A1P43005 524 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FNTAP49354 379 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AP3M2P53677 418 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NRLP54845 237 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RWDD2BP57060 319 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CORO7P57737 925 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PFKPQ01813 784 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CDR2Q01850 454 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GCNT1Q02742 428 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CAV1Q03135 178 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC20A2Q08357 652 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCY1Q08828 1119 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT71Q3SY84 523 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM153CQ494X1 144 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01559Q495D7 138 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 XKR3Q5GH77 459 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DENND2CQ68D51 928 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DUPD1Q68J44 220 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MTSS1LQ765P7 747 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KSR1Q8IVT5 923 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GPD1LQ8N335 351 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 URGCPQ8TCY9 931 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SHC3Q92529 594 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL8AQ96BM9 186 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF653Q96CK0 615 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP170P1Q96L14 293 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FNBP1Q96RU3 617 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR88Q9GZN0 384 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRDQ9H2X0 955 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPHQ9H3R5 247 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 AMACRQ9UHK6 382 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 DPP7Q9UHL4 492 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 POLIQ9UNA4 740 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 PPME1Q9Y570 386 aa7.4□□□□□ -1.22
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP205Q92621 2012 aa7.4□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL16O15467 120 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEB2O15479 319 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TTI1O43156 1089 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 EXTL3O43909 919 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPFIA2O75334 1257 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH2P05091 517 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFV2P19404 249 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMOD1P28289 359 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5DP30049 168 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1G1P47890 313 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NPTX2P47972 431 aa7.39□□□□□ -1.23
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