RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 USP37Q86T82 979 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-201ENST00000246533 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL29Q96CT2 875 aa27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-201ENST00000246533 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
CAPNS1-201ENST00000246533 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa27.45■■□□□ 1.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYP26A1O43174 497 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCNB1P14635 433 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 BRAFP15056 766 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 IVDP26440 423 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRA4P59901 499 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC38Q502W7 563 aa27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D31Q96DN5 1066 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 KREMEN1Q96MU8 473 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 CGRRF1Q99675 332 aa27.45■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC18A1P54219 525 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 NT5C1BQ96P26 610 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATP11AP98196 1134 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1841Q6NSI8 718 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMC2Q8TDI7 906 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 FBF1Q8TES7 1133 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TLE6Q9H808 572 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 URODP06132 367 aa27.42■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 TTPALQ9BTX7 342 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 DCLK3Q9C098 648 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA8P53708 1063 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNJ2P63252 427 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN10P78369 228 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC14Q15048 493 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 SURF1Q15526 300 aa27.41■■□□□ 1.98
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