RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pacsin1Q61644 441 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pi15Q8BS03 258 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 M1apQ9Z0E1 529 aa20.58■□□□□ 0.89
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp2c2A7L9Z8 944 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myo1eE9Q634 1107 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr731F8VQB9 326 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdk14O35495 469 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 C4bpaP08607 469 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd247P24161 164 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nudt18Q3U2V3 323 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q3UE31 404 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mgat5bQ765H6 792 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CslQ80X68 466 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kat6aQ8BZ21 2003 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ClasrpQ8CFC7 668 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp15Q8R5H1 981 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 BbxQ8VBW5 907 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Creb3l3Q91XE9 479 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asb11Q9CQ31 323 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cxxc1Q9CWW7 660 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abcb6Q9DC29 842 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr703Q9EPF5 319 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Clcn5Q9WVD4 746 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Il18rapQ9Z2B1 614 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Daw1D3Z7A5 415 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DgkdE9PUQ8 1220 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fcgr1P26151 404 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klf1P46099 358 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Senp1P59110 640 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smarcad1Q04692 1021 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc162pQ0VG85 912 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem26Q3UP23 366 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Papss1Q60967 624 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sema3cQ62181 751 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Efl1Q8C0D5 1127 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cox18Q8VC74 331 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnaaf1Q9D2H9 634 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 C1qtnf1Q9QXP7 281 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bex2Q9WTZ8 129 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sgk1Q9WVC6 431 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup10A2BIN1 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup14A2CEK7 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup19A9C497 187 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup15A9R9W0 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup17B5X0G2 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup8E9PVW0 235 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10719E9Q7T3 227 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup7E9QA79 235 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Grip2G3XA20 1042 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup6P02762 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup1P11588 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mup2P11589 180 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gja4P28235 333 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Actn4P57780 912 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acvrl1Q61288 502 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 BadQ61337 204 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gpr17Q6NS65 339 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wdr27Q8C5V5 780 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nlrp10Q8CCN1 673 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zdhhc5Q8VDZ4 715 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr478Q8VG04 314 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FtcdQ91XD4 541 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tm4sf5Q91XF2 196 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Syt10Q9R0N4 523 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adam23Q9R1V7 829 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eml5Q8BQM8 1977 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lrrc63A6H694 637 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nhsl2B1AXH1 854 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nedd9O35177 833 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Coro1aO89053 461 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 YwhazP63101 245 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gabrb2P63137 512 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 G2e3Q5RJY2 716 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr698Q7TRN4 311 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc187Q8C5V8 958 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mcoln2Q8K595 566 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Oas1cQ924S2 362 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1700069L16RikQ9D9H5 109 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnajb9Q9QYI6 222 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms