RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nudt8Q9CR24 210 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mms19Q9D071 1031 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MlklQ9D2Y4 472 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930513O06RikQ9D549 161 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ube4bQ9ES00 1173 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpsf3Q9QXK7 684 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem59Q9QY73 323 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ripk3Q9QZL0 486 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hic1Q9R1Y5 733 aa6.84□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mageb2A2AHM0 380 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3415J3QMS8 315 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MttpO08601 894 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GclmO09172 274 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps6ka3P18654 740 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fcer2P20693 331 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prim2P33610 505 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Matn1P51942 500 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dsc2P55292 902 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkcbP68404 671 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ikzf1Q03267 517 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxd4Q60688 444 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ints6lQ8BND4 861 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lamtor4Q8CF66 99 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kctd15Q8K0E1 283 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Irak3Q8K4B2 609 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dync1li1Q8R1Q8 523 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gbp7Q91Z40 638 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ecrg4Q99LS0 148 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smyd3Q9CWR2 428 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med7Q9CZB6 233 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3404Q9D506 307 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmbim4Q9DA39 238 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GmprQ9DCZ1 345 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prl2a1Q9JHK0 228 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Coro1cQ9WUM4 474 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scn1aA2APX8 2009 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb3cA2RSF9 386 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apol11aE9PZG0 334 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8444F6XS56 118 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5689F6Y2A6 97 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AlpiF8VPQ6 554 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap1O08715 857 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pik3r2O08908 722 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfm1O88998 485 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnnc2P20801 160 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glud1P26443 558 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn11P35235 597 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fen1P39749 378 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem165P52875 323 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lzts1P60853 599 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bop1P97452 732 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkcqQ02111 707 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prom2Q3UUY6 835 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxn1Q61575 648 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sp140Q6NSQ5 534 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp759Q7M6X3 721 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HomezQ80W88 542 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pi4kbQ8BKC8 816 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Daam1Q8BPM0 1077 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ago3Q8CJF9 860 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cys1Q8R4T1 145 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pglyrp2Q8VCS0 530 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam192aQ91WE2 254 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akr1c14Q91WT7 323 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mcrs1Q99L90 462 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AadacQ99PG0 398 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Commd8Q9CZG3 183 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bbs5Q9CZQ9 341 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Noxred1Q9D3S5 366 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpap3Q9D706 660 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan17Q9D7W4 270 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubb3Q9ERD7 450 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufa13Q9ERS2 144 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B4galt5Q9JMK0 388 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mnx1Q9QZW9 404 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RpgrQ9R0X5 1001 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atad5Q4QY64 1826 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn3A2ALK8 913 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc8D3YZV8 685 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl33G3UW92 533 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr611K7N609 323 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr612L7N462 323 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Has3O08650 554 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtgisO35074 501 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pde4aO89084 844 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IapP03975 557 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prkg1P0C605 671 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PolgP54099 1218 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grm1P97772 1199 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk7Q03147 346 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgprx2Q3UG50 352 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfhr2Q4LDF6 332 aa6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CttnQ60598 546 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klra8Q60682 266 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.1 ms