RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc187Q8C5V8 958 aa23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp10Q8CCN1 673 aa23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ClasrpQ8CFC7 668 aa23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oas1cQ924S2 362 aa23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr703Q9EPF5 319 aa23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r88E9Q235 316 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp4a14O35728 507 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atxn1lP0C7T6 687 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chrm1P12657 460 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tead2P48301 445 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3bp1P55194 680 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mc4rP56450 332 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eef1dP57776 281 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc185Q3V118 621 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wee2Q66JT0 555 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tshz2Q68FE9 1030 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr17Q6NS65 339 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DrgxQ8BYH0 263 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brd3Q8K2F0 726 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cox18Q8VC74 331 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prl5a1Q9JII2 230 aa23.75■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp40B1B1D3 796 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Npr1P18293 1057 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sox5P35710 763 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc25cP48967 447 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Senp1P59110 640 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BC051142Q3V0M8 400 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lsm8Q6ZWM4 96 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr698Q7TRN4 311 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NrcamQ810U4 1256 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcyox1lQ8C7K6 495 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrf1Q8VEC3 908 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700020D05RikQ99PB1 294 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ogfod3Q9D136 315 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nr4a3Q9QZB6 627 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NbnQ9R207 751 aa23.74■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FancfE9Q5Z5 343 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm7694J3QNH8 270 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RaraP11416 462 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 JundP15066 341 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VegfcP97953 415 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pacsin1Q61644 441 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr156Q6PCP7 798 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efl1Q8C0D5 1127 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Wdr27Q8C5V5 780 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r206Q8R277 312 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfhx2Q2MHN3 2562 aa23.73■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nhsl2B1AXH1 854 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm5814J3QP80 125 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AlyrefO08583 255 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rnf113a2Q14B01 337 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem26Q3UP23 366 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr19Q61121 415 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MmeQ61391 750 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sema3cQ62181 751 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clec2eQ80XD9 204 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc43a1Q8BSM7 564 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf131Q8K3J5 619 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Epn3Q91W69 636 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mzb1Q9D8I1 188 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phospho2Q9D9M5 241 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tcirg1Q9JHF5 834 aa23.72■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DgkdE9PUQ8 1220 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3336J3QMQ6 198 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Coro1aO89053 461 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 YwhazP63101 245 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AtminQ6P9S1 818 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mgat5bQ765H6 792 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdhhc17Q80TN5 632 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tsen34Q8BMZ5 316 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtrf1Q8K126 446 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc30a5Q8R4H9 761 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr478Q8VG04 314 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cul2Q9D4H8 745 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2c55Q9D816 490 aa23.71■■□□□ 1.39
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem235B1AQL3 211 aa23.7■■□□□ 1.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r176G3UW31 304 aa23.7■■□□□ 1.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sclt1G5E861 688 aa23.7■■□□□ 1.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FynP39688 537 aa23.7■■□□□ 1.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Foxp2P58463 714 aa23.7■■□□□ 1.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc39dQ0VF76 604 aa23.7■■□□□ 1.38
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rgs9bpQ148R9 237 aa23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms