RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636540.1

SRP54-AS1-205, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 565 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-205ENST00000636540 KRT31Q15323 416 aa11.67□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PM20D1Q6GTS8 502 aa11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 UBA3Q8TBC4 463 aa11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.67□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 NACA2Q9H009 215 aa11.67□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.67□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 ZBED1O96006 694 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 IRF1P10914 325 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RALAP11233 206 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ZNF18P17022 549 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TMEM196Q5HYL7 178 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 C10orf120Q5SQS8 335 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 PMF1Q6P1K2 205 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 Q6ZS52 159 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 OTUB2Q96DC9 234 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.66□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ACP6Q9NPH0 428 aa11.66□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.66□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 PES1O00541 588 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 THAP12O43422 761 aa11.65□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa11.65□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 PHOX2BQ99453 314 aa11.65□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.65□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TBC1D14Q9P2M4 693 aa11.65□□□□□ -0.54
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.65□□□□□ -0.54
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SRP54-AS1-205ENST00000636540 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LGALS16A8MUM7 142 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 E7ENQ6 273 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LAMTOR5O43504 91 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 STC2O76061 302 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ADH1CP00326 375 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 EGFP01133 1207 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 SP9P0CG40 484 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 ADH5P11766 374 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 TDGF1P13385 188 aa11.64□□□□□ -0.55
SRP54-AS1-205ENST00000636540 LCP1P13796 627 aa11.64□□□□□ -0.55
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