RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.99□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 COPEO14579 308 aa9.99□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 GCKP35557 465 aa9.99□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 BCAR1P56945 870 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPIL2Q13356 520 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 DBN1Q16643 649 aa9.99□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC6Q86X45 466 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.99□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CPB2Q96IY4 423 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF570Q96NI8 536 aa9.99□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 ELP3Q9H9T3 547 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARL8BQ9NVJ2 186 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 HEY2Q9UBP5 337 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC42Q9Y546 428 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.99□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC22O60826 627 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 RFPL1O75677 317 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 GABBR2O75899 941 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 CBX6O95503 412 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 APOEP02649 317 aa9.98□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TPBGLP0DKB5 382 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 BGNP21810 368 aa9.98□□□□□ -0.81
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IGHV3-54-201ENST00000622166 EPHB2P29323 1055 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 SDC4P31431 198 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 NR2C2P49116 596 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 SERPINB9P50453 376 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 NRLP54845 237 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 OVGP1Q12889 678 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 DPYSL2Q16555 572 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 CA9Q16790 459 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 STEAP4Q687X5 459 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 PMF1Q6P1K2 205 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF410Q86VK4 478 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 UNC93AQ86WB7 457 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC30AQ86WT1 665 aa9.98□□□□□ -0.81
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.98□□□□□ -0.81
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