RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 OAZ1P54368 228 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 NAPAP54920 295 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 NLRP5P59047 1200 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 BPIFB4P59827 614 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 FKBP1BP68106 108 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ADAM8P78325 824 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 PURAQ00577 322 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDC42EP1Q00587 391 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 EFEMP1Q12805 493 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 DUSP8Q13202 625 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 RAB39AQ14964 217 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC39A14Q15043 492 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SPATS1Q496A3 300 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 TCTN3Q6NUS6 607 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 POLNQ7Z5Q5 900 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CMTM4Q8IZR5 234 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANKRD53Q8N9V6 530 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 LINC00301Q8NCQ3 95 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 C3orf20Q8ND61 904 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SHCBP1Q8NEM2 672 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR7D4Q8NG98 312 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF480Q8WV37 535 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 C12orf42Q96LP6 360 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 AK8Q96MA6 479 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC37BQ96QE4 947 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 DEFB129Q9H1M3 183 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CUEDC2Q9H467 287 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 VCPKMTQ9H867 229 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGEF1Q9HAY2 307 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ARNT2Q9HBZ2 717 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 RIC8AQ9NPQ8 531 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 TDP1Q9NUW8 608 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLIP2Q9UDT6 1046 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 HACL1Q9UJ83 578 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.8□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLRN2A0PK11 232 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 GLTPD2A6NH11 291 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 F5H6K3 240 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP2A1O14983 1001 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 TBX3O15119 743 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYTH3O43739 400 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF623O75123 536 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM127O75204 238 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 TUSC2O75896 110 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 UBXN7O94888 489 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 NDUFB10O96000 172 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 HRGP04196 525 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC192P0DO97 292 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CMA1P23946 247 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 LONP1P36776 959 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ME1P48163 572 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CACNB3P54284 484 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 DSC2Q02487 901 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 GHRHRQ02643 423 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 DUSP2Q05923 314 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLRC3Q07444 240 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL10RAQ13651 578 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 RIN1Q13671 783 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 GRM7Q14831 915 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SEPT2Q15019 361 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR162Q16538 588 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 MST1LQ2TV78 715 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC157Q569K6 752 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 MFSD5Q6N075 450 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 PPP4R4Q6NUP7 873 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 Q6ZVL8 140 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 NEK8Q86SG6 692 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSPH3Q86UC2 560 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 DENND1CQ8IV53 801 aa3.79□□□□□ -1.8
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPR135Q8IZ08 494 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms