RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM11Q96F44 468 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYRFLQ96LU7 910 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCEEQ96PE7 176 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ISCUQ9H1K1 167 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IL37Q9NZH6 218 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NENFQ9UMX5 172 aa15.24■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF840PA6NDX5 716 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MBTPS2O43462 519 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TLR5O60602 858 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MOSPD3O75425 235 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CKMP06732 381 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRF1P10914 325 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RALAP11233 206 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCAM1P13591 858 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EPHA5P54756 1037 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EFEMP1Q12805 493 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MON1AQ86VX9 555 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MIB1Q86YT6 1006 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LEMD2Q8NC56 503 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C3orf20Q8ND61 904 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAM32Q8TC27 787 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 IRGQQ8WZA9 623 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRWD1Q9NSI6 2320 aa15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NCANO14594 1321 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM92AA1XBS5 289 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGAP6O43182 974 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSF2BPO75031 334 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DAB1O75553 588 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TBX18O95935 607 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HMBSP08397 361 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT3P12035 628 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SULT1E1P49888 294 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CDO1Q16878 200 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DCAF6Q58WW2 860 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HECTD3Q5T447 861 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DEFB106AQ8N104 65 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC22A12Q96S37 553 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUP85Q9BW27 656 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM204AQ9H8W3 233 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POPDC2Q9HBU9 364 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 THEGQ9P2T0 379 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COG5Q9UP83 839 aa15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 A0A0U1RQJ8 604 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANKRD62A6NC57 917 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MSI1O43347 362 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COCHO43405 550 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYBL1P10243 752 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLT3P36888 993 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GPC5P78333 572 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCML4Q8N228 414 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FGF13Q92913 245 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BTBD6Q96KE9 485 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CFAP57Q96MR6 1250 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYADMQ96S97 322 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM7Q9C029 511 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PARVAQ9NVD7 372 aa15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SCINQ9Y6U3 715 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms