RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615198.4

CPEB1-211, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,112 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-211ENST00000615198 PDK2Q15119 407 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 TAF11Q15544 211 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 LY6KQ17RY6 165 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 LRRC6Q86X45 466 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 TEX9Q8N6V9 391 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 NSL1Q96IY1 281 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 CREBZFQ9NS37 354 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 MKS1Q9NXB0 559 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.09■□□□□ 0.17
CPEB1-211ENST00000615198 A0A0G2JND7 137 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 M0QYV0 167 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NFICP08651 508 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 GSTA2P09210 222 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PRKCHP24723 683 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SERPINB4P48594 390 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 OSTNP61366 133 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 INCA1Q0VD86 236 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MMRN1Q13201 1228 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 FAM187BQ17R55 369 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TTC39CQ8N584 583 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 LRRC39Q96DD0 335 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ASB7Q9H672 318 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PDGFCQ9NRA1 345 aa16.08■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PYGBP11216 843 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TGM2P21980 687 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CAP1Q01518 475 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 HSDL1Q3SXM5 330 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NPNTQ6UXI9 565 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 C4orf22Q6V702 233 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ARMCX2Q7L311 632 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TMEM192Q8IY95 271 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TEKT4Q8WW24 435 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 FAF2Q96CS3 445 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 LACTBL1A8MY62 500 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZNF487B1APH4 448 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 GPR25O00155 361 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 DPYSL4O14531 572 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 GSC2O15499 205 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 STRNO43815 780 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 KRT37O76014 449 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ITGB3P05106 788 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MCF2P10911 925 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 IL4RP24394 825 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CCNFP41002 786 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NRLP54845 237 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TNFAIP2Q03169 654 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CDK18Q07002 472 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 BOLA3Q53S33 107 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TRNP1Q6NT89 227 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TRIM50Q86XT4 487 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PLD5Q8N7P1 536 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NLRP4Q96MN2 994 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PRPSAP2O60256 369 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ENTPD5O75356 428 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 PDGFRAP16234 1089 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SERPINB3P29508 390 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 ORC1Q13415 861 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MTM1Q13496 603 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 LGSNQ5TDP6 509 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 JADE1Q6IE81 842 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 MCUQ8NE86 351 aa16.06■□□□□ 0.16
CPEB1-211ENST00000615198 AFG1LQ8WV93 481 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms