RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.82■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 CARNS1A5YM72 827 aa20.82■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 F8VZ95 297 aa20.82■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB11Q96P15 392 aa20.81■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 CYP2F1P24903 491 aa20.81■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 RFX3P48380 749 aa20.81■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 MARC1Q5VT66 337 aa20.81■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 ZPBP2Q6X784 338 aa20.81■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 TFR2Q9UP52 801 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 LACTBL1A8MY62 500 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 C10orf53Q8N6V4 93 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 MSRAQ9UJ68 235 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SLITRK3O94933 977 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 WDR41Q9HAD4 459 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 TGM3Q08188 693 aa20.8■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 EXD1Q8NHP7 514 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 TADA1Q96BN2 335 aa20.8■□□□□ 0.92
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CTDP1-208ENST00000613122 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 KCNB2Q92953 911 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINB12Q96P63 405 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 SERPINF2P08697 491 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 CYTH1Q15438 398 aa20.79■□□□□ 0.92
CTDP1-208ENST00000613122 RPAINQ86UA6 219 aa20.79■□□□□ 0.92
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