RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP8B3	O60423	1300 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TLR5	O60602	858 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	AP1G2	O75843	785 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TBX18	O95935	607 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXB2	P14652	356 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM193A	P78312	1265 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA3B	Q13214	749 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	BIRC3	Q13489	604 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CUL4B	Q13620	913 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOA4	Q13772	614 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	IQUB	Q8NA54	791 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN10	Q9HC96	672 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KLK13	Q9UKR3	277 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNG3	O60359	315 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC3	O60645	756 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CUTA	O60888	179 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	PHACTR2	O75167	634 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CLSTN1	O94985	981 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFV2	P19404	249 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NTSR1	P30989	418 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXD12	P35452	270 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	DLG4	P78352	724 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN10	P78369	228 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	AMPD3	Q01432	767 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf29	Q8N999	325 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TNIP3	Q96KP6	325 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD54B	Q9Y620	910 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MDM4	O15151	490 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP26A1	O43174	497 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	AP5Z1	O43299	807 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	YEATS4	O95619	227 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINF2	P08697	491 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TYR	P14679	529 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	AFM	P43652	599 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ASPA	P45381	313 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NDST1	P52848	882 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF33A	Q06730	810 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HTR3D	Q70Z44	454 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TWNK	Q96RR1	684 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRG3	Q99928	467 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	BBS2	Q9BXC9	721 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NACA2	Q9H009	215 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CYLD	Q9NQC7	956 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	HHLA1	C9JL84	531 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRC4	O43908	158 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	DPP6	P42658	865 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-233	ENST00000602338	STK4	Q13043	487 aa		12.61	□□□□□ -0.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms