RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 FAF2Q96CS3 445 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 DCLK3Q9C098 648 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 IL37Q9NZH6 218 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.83■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 TJP3O95049 919 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 FGBP02675 491 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 USP17L7P0C7H9 530 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 RDXP35241 583 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 GRIK1P39086 918 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 GLUD2P49448 558 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 AIF1P55008 147 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 DR1Q01658 176 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 BADQ92934 168 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 NTAN1Q96AB6 310 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM169Q96HH4 297 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SPATA17Q96L03 361 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC9A7Q96T83 725 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 YME1L1Q96TA2 773 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF670Q9BS34 389 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 COMMD8Q9NX08 183 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SPG21Q9NZD8 308 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 AMACRQ9UHK6 382 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ERLIN1O75477 346 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 IGLV3-25P01717 112 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 COILP38432 576 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PTGIRP43119 386 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ROR1Q01973 937 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SCAPQ12770 1279 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 DPYSL3Q14195 570 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CCNG2Q16589 344 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 DCAF6Q58WW2 860 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ODF2Q5BJF6 829 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM240Q5SV17 173 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SYPL2Q5VXT5 272 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF365Q70YC5 407 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 OTOP2Q7RTS6 562 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 JAMLQ86YT9 394 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 C7orf61Q8IZ16 206 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 HERVK_113Q902F9 699 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM51Q9NW97 253 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SCML2Q9UQR0 700 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CDY1Q9Y6F8 540 aa15.81■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR27A2RRH5 827 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 TTI1O43156 1089 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CD48P09326 243 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CDR1P51861 262 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 EPHB4P54760 987 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC7A5Q01650 507 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ADCY2Q08462 1091 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 FAM117BQ6P1L5 589 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 IFT20Q8IY31 132 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 NUP93Q8N1F7 819 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 ATAD1Q8NBU5 361 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 KCTD6Q8NC69 237 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 HSPH1Q92598 858 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 HEMGNQ9BXL5 484 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 RAB17Q9H0T7 212 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 CRISPLD1Q9H336 500 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 SMOC2Q9H3U7 446 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 AAASQ9NRG9 546 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 PIGVQ9NUD9 493 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 AP4E1Q9UPM8 1137 aa15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-214ENST00000589769 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms