RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PLVAPQ9BX97 442 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF576Q9H609 170 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NMUR1Q9HB89 426 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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CAPNS1-208ENST00000589162 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 COG5Q9UP83 839 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 YIPF1Q9Y548 306 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.34□□□□□ -1.39
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CAPNS1-208ENST00000589162 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PRRG1O14668 218 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MDM4O15151 490 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ABLIM3O94929 683 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LCA5LO95447 670 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RB1P06400 928 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 H2AFZP0C0S5 128 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC175P0C221 793 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 USP17L7P0C7H9 530 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP8P22894 467 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PAX3P23760 479 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC5A3P53794 718 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NTHL1P78549 312 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TWF1Q12792 350 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.34□□□□□ -1.39
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CAPNS1-208ENST00000589162 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 H2AFVQ71UI9 128 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS36Q86VN1 386 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ERICH1Q86X53 443 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF677Q86XU0 584 aa6.34□□□□□ -1.39
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CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA18Q8TC71 538 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 EDEM1Q92611 657 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP85Q9BW27 656 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ISCUQ9H1K1 167 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LHX5Q9H2C1 402 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNCQ9H7C4 482 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GMIPQ9P107 970 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.34□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NCANO14594 1321 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP8B3O60423 1300 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PQH9 124 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 E7ENQ6 273 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF10BO14763 440 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCGO15287 622 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NCK2O43639 380 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TADA3O75528 432 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C8AP07357 584 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SETSIPP0DME0 302 aa6.33□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNT1P13805 278 aa6.33□□□□□ -1.4
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