RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588977.1

CPD-210, Transcript of carboxypeptidase D, humanhuman

TSL 5

Gene CPD, Length 357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPD-210ENST00000588977 ADAMTS3O15072 1205 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 PDE8BO95263 885 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 FGAP02671 866 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 FPR3P25089 353 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 PSG6Q00889 435 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 FHL3Q13643 280 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 STARD3Q14849 445 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 RAB30Q15771 203 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 SKAP1Q86WV1 359 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 MUL1Q969V5 352 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 REPS1Q96D71 796 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 WDR24Q96S15 920 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 SNX15Q9NRS6 342 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.09□□□□□ -1.59
CPD-210ENST00000588977 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TARM1B6A8C7 271 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TMPRSS11DO60235 418 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 PROP1O75360 226 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 JTBO76095 146 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 WDR47O94967 919 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 YY1P25490 414 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 MCM5P33992 734 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 GRM1Q13255 1194 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 BIRC2Q13490 618 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 ATP1A4Q13733 1029 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 ACOX1Q15067 660 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 DENND2CQ68D51 928 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 C1orf228Q6PIY5 440 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 RD3Q7Z3Z2 195 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 RPS6KC1Q96S38 1066 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 CIPCQ9C0C6 399 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.08□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 A0A087WV62 115 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 CBFA2T3O75081 653 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TMEM225BP0DP42 221 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 ADRA1DP25100 572 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 DIO1P49895 249 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TNFAIP2Q03169 654 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 LMAN2Q12907 356 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 MTAPQ13126 283 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TRIM72Q6ZMU5 477 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TERB1Q8NA31 727 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 NELL1Q92832 810 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 VPS50Q96JG6 964 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 SNX18Q96RF0 628 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 MMS19Q96T76 1030 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 CRB3Q9BUF7 120 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 CA14Q9ULX7 337 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 COX11Q9Y6N1 276 aa5.07□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 H7C1Q1 480 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 FFAR2O15552 330 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 EXOC3O60645 756 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 PEX14O75381 377 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 VIPP01282 170 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 DEUP1Q05D60 604 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.06□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.05□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 F5H423 210 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CPD-210ENST00000588977 PIP5K1BO14986 540 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms