RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RTP4	Q96DX8	246 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CPB2	Q96IY4	423 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CABS1	Q96KC9	395 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF560	Q96MR9	790 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZWILCH	Q9H900	591 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HESX1	Q9UBX0	185 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM120B	A0PK00	339 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914		A6NJY4	79 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMIM23	A6NLE4	172 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HAS3	O00219	553 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MDM4	O15151	490 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KPNA6	O60684	536 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NPTXR	O95502	500 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	S1PR4	O95977	384 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PFKM	P08237	780 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GSTA2	P09210	222 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GNAT1	P11488	350 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	BRAF	P15056	766 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PDGFRA	P16234	1089 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAGEA6	P43360	314 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	VPS41	P49754	854 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CPT1A	P50416	773 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ADAM17	P78536	824 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC6A3	Q01959	620 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	IFT88	Q13099	833 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	XRCC4	Q13426	336 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NOMO1	Q15155	1222 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	LLGL1	Q15334	1064 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	VSTM1	Q6UX27	236 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ATCAY	Q86WG3	371 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RFX6	Q8HWS3	928 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GJD3	Q8N144	294 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PDIK1L	Q8N165	341 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	APBB2	Q92870	758 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HAUS1	Q96CS2	278 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAF2	Q96CS3	445 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MYO19	Q96H55	970 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HSFY1	Q96LI6	401 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MAGEB18	Q96M61	343 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF670	Q9BS34	389 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	IL21	Q9HBE4	155 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914		E5RJQ4	531 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	PIR	O00625	290 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	APOL1	O14791	398 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	CHAD	O15335	359 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM155B	O75949	473 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	GNRH1	P01148	92 aa		7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
EFTUD2-208	ENST00000587914	HOXC8	P31273	242 aa		7.49	□□□□□ -1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms